用于菌群结构谱或宏基因组测序分析的皮肤微生物取样方法
一、样本筛选
1、如果受试者存在以下情况,则需剔除:
(1)采样前7天,脸部,头皮,脖子,胳膊,前臂或者手使用过抗生素或者萜类物质者;
(2)脸部,胸部,背部或者肩膀有痤疮者;
(3)头皮,脸,脖子,手臂,前臂或者手上有水泡,脓疱,疮,脓肿,腐烂或者溃疡者;
(4)在4c2取样部位处有一处水泡,脓疱,疮,脓肿,腐烂,溃疡,藓,伤口,裂纹或者色素及粉红色的皮肤修复区者;
(5)身上有多处粉色或红色皮肤区域者(暗指牛皮癣或者湿疹患者);
(6)手掌或者脚掌皮肤增厚或者有裂纹者;
(7)两周之内,每天使用去屑洗发水都不能清理干净头皮屑者;
(8)身体一处或者多处有散发型皮疹者。
2、志愿者的皮肤检查要在灯光良好情况下进行,并且要对全身有全面彻底的检查。
3、耳后的折痕(左右耳后面)和两个胳膊腋窝要仔细检查。
二、准备材料
1、无菌螺旋盖收集管(如 MoBio 收集管);
2、无菌生理盐水;
3、标签纸;
4、Mark 笔和签字笔;
5、无菌脱脂棉签;
6、密封塑料袋;
7、-80°C冰箱;
8、一次性手套;
9、碎冰或冰袋,最好是干冰;
10、冰盒。
三、收集方法
1、在无菌拭子管管盖和管壁上都写上样品名称,注意,样品名称只能用英文字母或阿拉伯数字或两者的组合,而且字符数不小于3且不大于9;
2、将无菌的脱脂棉签在无菌生理盐水中浸湿,在实验目的区域擦拭30s,擦拭面积4c2;
3、样本采集后应放入无菌螺旋盖收集管;收集好收集管后,用自封袋封存,置于冰上,2h 内运输到实验室,-80°C保存。
四、人类皮肤常见菌群
一类为常驻菌群,较固定地寄生于皮肤,数量和菌种的组成保持相对稳定;另一类为暂驻菌群,主要存在于暴露部位的皮肤,其数量和菌类有很大的变化。此外,还有一些微生物偶尔存在于少数人体上,称为偶存菌,仅在短时期内附着于皮肤和增殖,此受环境及常驻菌群活性的影响。常驻菌群寄生在角质层表面和表皮的最外层中。常见的有:微球菌科(包括凝固酶阴性葡萄球菌、类球菌、微球菌属),棒状微生物(包括棒状杆菌属、短颈细菌属),丙酸菌属,糠秕孢子菌属。
五、送样方法
所有样品采集完毕后联系北京微生太科技有限公司取样。微生太将派送干冰到样品所在地,将样品放进派送干冰的泡沫盒,封严后交给物流师傅既可。
六、参考文献
1、Distinct cutaneous bacterial assemblages in a sampling of South American Amerindians and US residents, The ISME Journey, 2013.
2、Skin Microbiome Imbalance in Patients with STAT1/STAT3 Defects Impairs Innate Host Defense Responses, J Innate Immun, 2013.
如果您对微生态研究感兴趣,我们可以邀请您进入对应专业的微生态学术微信群。这些微信群旨在为微生态研究者提供交流平台,而且我们会通过网络举办一系列的微生态研究技术讲座,分享一系列相关研究文献,举办一系列交流研究成果的学术活动。
入群的方法是扫描或长按江舜尧微信二维码,加江舜尧为好友,然后江舜尧邀请您进入微信群。